本院感染科住院及門診患者之治療，並執行全院有關感染症及抗微生物劑使用之會診及諮詢，診治對象以由微生物引起之感染症為主，不限於一般之傳染疾病。此外，各種原因引起之發燒及不明熱，同時為本科診療及研究對象。本科亦負責院內感染控制的工作，按疾病管制局之規定通報法定傳染症，並執行疾病管制局及地方衛生單位交付之任務，並實際督導院內的防治工作。同時本科亦與微生物組密切配合，相輔相成以達服務病患及教學相長之目標。